Для Томаса (Dylan O‘Brien) и его соратников Минхо (Ki Hong Lee), Ньюта (Thomas Brodie Sangster) и отважной компании опасный для жизни путь из лабиринта к предполагаемой свободе заканчивается новым бараком. В постапокалиптическом мире, население которого уносится вирусом зомби, группа молодых людей, известных как Глэдерс, снова попадает в лапы загадочной правительственной организации безопасности WCKD (World Catastrophe Killzone Department), которую они используют для экспериментов. Старший надзиратель-суперинтендант Янсон (Aidan Gillen) правит твердой рукой, оставляя молодежь в неведении о том, что их цветет. Когда ее подруга Тереза (Кайя Скоделарио) исчезает в герметично запертом комплексе, главный герой хочет выйти на след тайны. То, что он обнаруживает, шокирует настолько, что парень с товарищами по несчастью планирует бежать из завода в негостеприимную, опустошенную и очень жестокую пожарную пустыню, где, как говорят, укрылись повстанцы.
